从回收的学习

从那些谁了covid,19个样品可以照亮真正的感染率,杀伤力,疫苗

Microscope image of virus particles in blue against a pale background
新型冠状病毒。图像:NIH / NIAID

研究人员在美国188体育官网医学院和布里格姆妇女医院的布拉瓦尼克学院正在适应研究该新型冠状病毒的感染,是造成当前全球性流行病的后果抗体检测工具。

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的工具,叫做virscan,检测人的血液指示由病毒和细菌活跃,过去感染的抗体。它是在2015年开发 斯蒂芬·埃利奇,遗传学的孟德尔教授,HMS和Brigham和妇女的药,并在实验室中2名名博士研究生, 徐亮托马斯·库拉.

因为它需要5〜10天为一个人产生抗体,elledge强调,virscan不会被用来提供感染的实时诊断与SARS-COV-2,病毒引起covid-19。

相反,我们的目标是分析从谁从感染中恢复,以了解病毒如何影响免疫系统和疾病的流行病学人的血液样本。

一旦展开,努力将参加世界各地的人试图研究后感染的血液样本。该结果可能通过捕捉可能已经被发现,并可以通知疫苗的发展情况下会导致真正的感染和致死率更好的估计。他们还可以揭示新的见解人体免疫力的基础。

“这种情况现在是非常困难的,但它是伟大的,是在应用所有这些新的方法来人类重要的健康问题的位置,说:” elledge。

如何做virscan工作?它是如何从诊断测试有什么不同?

从一滴血, virscan 测试针对的,可能有感染的人,无论是周围测试或几十年前的时候病毒和细菌超过1000个不同菌株的抗体。这不同于被称为ELISA测定,其中在一个时间寻找一种病原体典型血液测试。

它也不同于目前用来诊断covid-19的测试。这些测试依赖于从鼻子和喉咙,并期待粘液样本进行核酸的信号,即SARS冠状病毒2型病毒包含了样本。

“疾控中心等检测设施正在寻找的病毒,这是非常关键的存在,说:” elledge。 “我们的检测可以检测人的免疫系统是否从事病毒。我们可以告诉当有人窝藏了病毒,但没有它了。”

创建virscan,elledge,库拉和许建表位的文库:从病毒的表面衍生的短蛋白质片段。如果一个人遇到特定病毒株,他们的免疫系统已经产生反对的抗体。那么这些抗体会认识到在virscan库并绑定到它的表位,给人一种积极的结果。

elledge的实验室包括从原来的virscan集合在几个不同的冠状病毒抗原表位。球队现在将在新的冠状病毒,以及尚未纳入所有其他已知的冠状病毒抗原表位。

可以virscan用于测试人当前是否有covid-19?

有几个原因,包括它至少需要一个星期产生结果的事实,virscan不能用作实时诊断测试。

“它不是点护理测试是可行的,”说elledge。然而,他补充说,他的团队可能能够利用获得的产生的virscan更快的版本信息。

当项目得到启动和运行,这将是至关重要的,以确保血液样本只能从谁从SARS-COV-2感染完全恢复民,用之于民,使瓶不含有活性冠状病毒粒子,当他们进入实验室。

“我们不想感染我们的研究人员说,” elledge。

工作如何改进的感染和死亡率的估计?

到目前为止,有限的测试意味着,人在美国的人数不详超越已经感染了SARS-COV-2,但仍无法统计。有些人可能不出现症状。一些症状可能被归因于其他原因。这不仅是留给个人想知道自己的感染与免疫状态,但也掩盖了在人群中真正的感染率。并且不知道有多少人被感染,这是不可能计算病死率,如何在新的冠状病毒可能会杀死它感染人体。

上运行的血液或血清virscan分析,从人口的相当大的部分可以提供多少人在特定的地理区域被感染“的可靠估计”,说elledge。与谁药检呈阳性而死亡者的医疗记录交叉引用,这些信息可以照亮病毒的真正的致死率。

“因为现在他们说,‘这许多人进来了,药检呈阳性,’和‘这么多死了,’但如果有很多人谁不生病不足以去医院,谁没有得到测试,它使病毒看起来更具杀伤力比它可能是,”说elledge。

virscan如何告知疫苗的开发?

virscan承诺帮助elledge和他的同事识别病毒的部分免疫系统响应。

最近从他的研究小组的研究表明,人感染对同一proteins-“即使是同一氨基酸” -on该病毒特定的病毒产生抗体遍布全球,elledge说。

这是令人惊讶的,考虑到许多表位病毒是如何,以及有多少抗体在体内的阿森纳,说elledge。结果导致他怀疑某些表位,实际上,诱饵,因此,并非所有的抗体具有所需的中和作用。

“免疫系统可能发送了所有这些抗体喜欢拍摄猎枪,并希望一些喷雾将命中目标,消除病毒的一些关键部分,”他说。

原则上说,elledge,virscan可能表明该表位是针对新的冠状病毒有用的指标,哪些只是噪音。然后研究人员可以消除疫苗开发的是无用的人.

该实验室是怎么回事,致力于帮助疫苗的努力?

抗体是不是在身体攻击入侵者的唯一对象。免疫细胞T细胞也发生反应,特异性抗原决定簇,不是病毒,但感染细胞的表面上。提醒这些表位的危险,T细胞可以杀死病毒感染的细胞和限制由在体内的病毒数量。

在2005年,elledge实验室建立了一个工具, T-扫描,可以检测这些表位。他现在想教T-扫描,以检测电池是否由新型冠状病毒感染的抗原表位做。但由于不同的病毒和细菌感染的细胞发芽不同表位,他首先需要知道表位的样子与此冠状病毒感染。这将需要从谁从SARS-COV-2感染中恢复的人获得,不仅血,而且T细胞,他说。

目标:识别的表位触发T细胞攻击,因此,研究人员劳动制定covid-19疫苗可包括他们的组合。

“T细胞表位通常是在疫苗和预防病毒感染的重要球员,”说elledge。 “要鼓励T细胞杀死被感染的细胞。”

virscan如何可以照亮什么SARS-COV-2确实给免疫系统?

去年,该小组利用virscan来帮助揭示如何 麻疹感染 消灭了其他病毒和细菌感染以往的免疫系统内存。 virscan同样可以照亮人们是否产生免疫力的新型冠状病毒,它们是如何长久保持免疫和感染是否会引起更广泛的损害免疫系统像麻疹一样。

或病毒可能在商店里其他的惊喜,说elledge。

有关的可能性是什么,有新的冠状病毒的不同毒株?

虽然在许多病毒突变已在世界各地记录到今天为止,这些变化“不会影响抗体了,”所以virscan的结果应该仍然适用,说elledge。

其样本将进行分析?

对于最初的研究中,elledge设想约100名志愿者谁已经从covid-19回收收集样品。在最好的情况下会前和感染后有来自人的样本,他说,虽然他承认,这将是很难安排。

“很多人在实验室里给样品过去,所以如果有人生病了,我们会前后有,但当然我们希望不会发生,”他说。

当将所有这一切准备好?

最HMS实验室有 过渡到远程工作 以下 机构指导 旨在遏制病毒的传播,但一些已获准继续在现场为covid-19相关的项目工作,包括elledge实验室的一部分.

elledge预计virscan可以部署分析四月中旬样本。那么这将是获取人类研究伦理审查委员会的批准和安排收集样本的物流的问题。 elledge目前正在与整个HMS接触和更广泛的社区波士顿举行会谈。

还有什么是在工作?

与此同时,elledge的团队正在使用的工具,他们在2014年开发了一个名为检测反对甚至更高的敏感度新型冠状病毒抗体 柏拉图。而virscan用途短,直链蛋白质片段,柏拉图使用称为开放阅读框架,或ORF的,其具有较发达的三维结构的全长蛋白质。 (柏拉图代表翻译ORF的平行分析。) 

谁资助了这项工作?

elledge是霍华德休斯医学研究所的研究员。